Os dendrímeros emergiram nas últimas décadas como novos sistemas de transporte de fármacos. O uso de ferramentas computacionais é uma mais-valia no processo de desenvolvimento de novos fármacos e de sistemas de transporte de fármacos, mostrando-se particularmente úteis no desenho racional e aplicação destes sistemas. A aplicação da modelação molecular a dendrímeros ajuda a prever padrões estruturais e propriedades moleculares que guiam o desenvolvimento de novos transportadores de moléculas de interesse terapêutico e de diagnóstico. Neste sentido, vários estudos têm contribuído para caracterizar e elucidar a interação de dendrímeros com diversas moléculas e macromoléculas. Em geral, o uso de ferramentas computacionais nestes estudos tem contribuído para uma melhor compreensão da estrutura e das interações dos dendrímeros a nível molecular.